Modul EW4170 T

Modulteil: Systembiologie (SystBioT)


Dauer

1 Semester

Angebotsturnus

Jedes Wintersemester

Leistungspunkte

4

Studiengang, Fachgebiet und Fachsemester:

  • Master Entrepreneurship in digitalen Technologien 2020, Modulteil eines Wahlmoduls, Modulteil, Beliebiges Fachsemester
  • Master Informatik 2019, Modulteil eines Wahlmoduls, Modulteil, Beliebiges Fachsemester

Lehrveranstaltungen:

  • EW4170-Ü: Einführung in die klassische und translationale Systembiologie (Übung, 2 SWS)
  • EW4170-V: Einführung in die klassische und translationale Systembiologie (Vorlesung, 2 SWS)

Workload:

  • 60 Stunden Präsenzstudium
  • 50 Stunden Selbststudium
  • 10 Stunden Prüfungsvorbereitung

Lehrinhalte:

  • Einführung in das Genom und Proteom von zellulären Systemen
  • Netzwerke: zelluläre, genetische, genregulatorische Netzwerke, Interaktom, Transkriptom und Proteom
  • Analyse von dynamischen Systemen: Fixpunkte, Bifurkationen, Feedback
  • Anwendungsbeispiele translationaler Systembiologie
  • Bioinformatische Analysen von Omics Daten
  • Einführung in öffentliche Datenbanken: z.B. STRING, Gene Expression Omnibus, TCGA, KEGG, Reactome, MSigDB
  • Übungen: Praktische Übungen zu Analyse von dynamischen Systemen und zellulären Signalwegen in R
  • Übungen zum Einlesen, Analysieren und Visualisieren von hochdimensionalen Daten mit R
  • Übungen zur Analyse von Proteininteraktionsnetzwerken

Qualifikationsziele/Kompetenzen:

  • Die Studierenden sind in der Lage, die Grundkonzepte der Signalverarbeitung in Lebewesen zu erklären
  • Sie können Begriffe wie Genom, Transkriptom, Interaktom und Proteom richtig einzuordnen
  • Sie können dynamische Systeme und deren Eigenschaften analysieren
  • Sie kennen die gängigen Methoden / bioinformatischen Algorithmen
  • Praktischen Übungen werden die Studenten ermutigen, ihr Wissen zu diesen Themen zu vertiefen

Vergabe von Leistungspunkten und Benotung durch:

  • Übungsaufgaben
  • Klausur

Modulverantwortliche:

Lehrende:

Literatur:

  • Marian Walhout, Marc Vidal, Job Dekker : Handbook of Systems Biology: Concepts and Insights (Englisch) Gebundene Ausgabe – 15. November 2012
  • Edda Klipp, Wolfram Liebermeister, Christoph Wierling, Axel Kowald; : Systems Biology: A Textbook Englisch) Taschenbuch – 20. April 2016
  • Yoram Vodovotz and Gary : An Translational Systems Biology, Concepts and Practice for the Future of Biomedical Research

Sprache:

  • Wird nur auf Englisch angeboten

Bemerkungen:

(Ist Teilmodul von CS4516-KP12, CS5400)

Veranstaltungen auch genutzt in CS4442-KP12.

Letzte Änderungen:

29.10.2019