Modul EW3502-KP05

Dauer

1 Semester

Angebotsturnus

Jedes Wintersemester

Leistungspunkte

5

Studiengang, Fachgebiet und Fachsemester:

• Bachelor Medizinische Ernährungswissenschaft 2024, Wahlpflicht, Ernährungswissenschaften, 5. Fachsemester
• Bachelor Angebot fächerübergreifend für Gesundheitswissenschaften, Wahlpflicht, Fächerübergreifende Module, Beliebiges Fachsemester
• Bachelor Medizinische Ernährungswissenschaft 2018, Wahlpflicht, Ernährungswissenschaften, 5. Fachsemester
• Bachelor Medizinische Ernährungswissenschaft 2016, Wahlpflicht, Ernährungswissenschaften, 5. Fachsemester

Lehrveranstaltungen:

• EW3502-S: Mikrobiomik (Seminar / Übungen, 1 SWS)
• EW3502-V: Mikrobiomik (Vorlesung, 2 SWS)

Workload:

• 45 Stunden Präsenzstudium
• 105 Stunden Selbststudium

Lehrinhalte:

• Einführung in die Grundlagen und Terminologie der Systembiologie (Einführung der omics)
• Mikroorganismen auf der Erde, Mikrobielle Artenvielfalt und Konsortien in der natürlichen Umwelt und der Humanmedizin
• Rolle des Mikrobioms für die Ernährung (Mikrobiom-Darm-Wechselwirkungen), Wirt- (Tier, Mensch) assoziierten Mikroorganismen
• Methoden der next generation Sequenzierungsanalysen
• Analyse mikrobieller Gemeinschaften mit Hilfe kultivierungsunabhängiger Methoden (Mikrobiomsequenzierungen)
• Bioinformatische Analysen von Mikrobiom-, Genom- und Transkriptom-Daten
• Funktionelle Mikrobiomik: Metabolomik
• Seminar/Übung: Einführung in R
• Seminar/Übung: kurze Einführung in statistisches Testen (parametrisches/nicht parametrisches Testen)
• Seminar/Übung: Programme zur Vorverarbeitung von Mikrobiomdaten (qiime, mothur, u/vsearch)
• Seminar/Übung: Datenbanken/Ansätze zur taxonomischen Klassifizierung von Mikrobiomdaten
• Seminar/Übung: Analyse von Mikrobiomdaten mit R (Pakete: vegan, phyloseq, ggplot2)
• Seminar/Übung: Indikatorspezies identifizieren mittels verschiedener Ansätze
• Seminar/ Übung: Grundlage der Mikrobiologie, Rolle der Mikrobiom im Kontext von: Darm-Gehirn Axis, Probiotika, Schwangerschaft und Immunität; Vorstellung der neusten Publikation in Thema Mikrobiomik

Qualifikationsziele/Kompetenzen:

• Die Studierenden verfügen über breites und integriertes Wissen in der Mikrobiomik sowie über die praktische Anwendung von systembiologischen Verfahren.
• Sie besitzen ein kritisches Verständnis systembiologischer und bioinformatischer Analysen.
• Die Studierenden verfügen über ein breites Spektrum an geeigneten Methoden zur Beurteilung komplexer systembiologischer Zusammenhänge im Kontext der Mikrobiomik.
• Die Studierenden können komplexe Aspekte aus beispielhaften Bereichen der Mikrobiomik gegenüber Fachleuten fachsprachlich korrekt erläutern, argumentativ vertreten und gemeinsam weiterentwickeln.
• Sie definieren, reflektieren und bewerten die Ziele für Lern- und Arbeitsprozesse selbstständig und können diese Prozesse eigenständig und nachhaltig gestalten.

Vergabe von Leistungspunkten und Benotung durch:

• Regelmäßige Teilnahme (>80 %)
• Präsentation

Modulverantwortliche:

• Prof. Dr. med. Christian Sina

Lehrende:

• Institut für Chemie und Metabolomics
• Institut für Ernährungsmedizin
• Lübecker Institut für Experimentelle Dermatologie (LIED)
• Prof. Dr. Hauke Busch
• Dr. Axel Künstner
• Prof. Dr. med. Christian Sina
• Dr. rer. nat. Anna Kordowski
• Prof. Dr. rer. nat. Ulrich Günther

Literatur:

• David N. Fredricks : The Human Microbiota: How Microbial Communities Affect Health and Disease
• Noureddine Benkeblia : Omics Technologies: Tools for Food Science
• Sara El-Metwally : Next Generation Sequencing Technologies and Challenges in Sequence Assembly SpringerBriefs in Systems Biology

Sprache:

• Wird nur auf Deutsch angeboten

Bemerkungen:

Letzte Änderungen:

02.10.2025