Modul EW4170 T
Modulteil: Systembiologie (SystBioT)
Dauer
1 Semester
Angebotsturnus
Jedes Wintersemester
Leistungspunkte
4
Studiengang, Fachgebiet und Fachsemester:
- Master Entrepreneurship in digitalen Technologien 2020, Modulteil eines Wahlmoduls, Modulteil, Beliebiges Fachsemester
- Master Informatik 2019, Modulteil eines Wahlmoduls, Modulteil, Beliebiges Fachsemester
Lehrveranstaltungen:
- EW4170-Ü: Einführung in die klassische und translationale Systembiologie (Übung, 2 SWS)
- EW4170-V: Einführung in die klassische und translationale Systembiologie (Vorlesung, 2 SWS)
Workload:
- 60 Stunden Präsenzstudium
- 50 Stunden Selbststudium
- 10 Stunden Prüfungsvorbereitung
Lehrinhalte:
- Einführung in das Genom und Proteom von zellulären Systemen
- Netzwerke: zelluläre, genetische, genregulatorische Netzwerke, Interaktom, Transkriptom und Proteom
- Analyse von dynamischen Systemen: Fixpunkte, Bifurkationen, Feedback
- Anwendungsbeispiele translationaler Systembiologie
- Bioinformatische Analysen von Omics Daten
- Einführung in öffentliche Datenbanken: z.B. STRING, Gene Expression Omnibus, TCGA, KEGG, Reactome, MSigDB
- Übungen: Praktische Übungen zu Analyse von dynamischen Systemen und zellulären Signalwegen in R
- Übungen zum Einlesen, Analysieren und Visualisieren von hochdimensionalen Daten mit R
- Übungen zur Analyse von Proteininteraktionsnetzwerken
Qualifikationsziele/Kompetenzen:
- Die Studierenden sind in der Lage, die Grundkonzepte der Signalverarbeitung in Lebewesen zu erklären
- Sie können Begriffe wie Genom, Transkriptom, Interaktom und Proteom richtig einzuordnen
- Sie können dynamische Systeme und deren Eigenschaften analysieren
- Sie kennen die gängigen Methoden / bioinformatischen Algorithmen
- Praktischen Übungen werden die Studenten ermutigen, ihr Wissen zu diesen Themen zu vertiefen
Vergabe von Leistungspunkten und Benotung durch:
- Übungsaufgaben
- Klausur
Modulverantwortliche:
Lehrende:
- Lübecker Institut für Experimentelle Dermatologie (LIED)
- Prof. Dr. Hauke Busch
- Dr. Axel Künstner
- MitarbeiterInnen des Instituts
Literatur:
- Marian Walhout, Marc Vidal, Job Dekker : Handbook of Systems Biology: Concepts and Insights (Englisch) Gebundene Ausgabe 15. November 2012
- Edda Klipp, Wolfram Liebermeister, Christoph Wierling, Axel Kowald; : Systems Biology: A Textbook Englisch) Taschenbuch 20. April 2016
- Yoram Vodovotz and Gary : An Translational Systems Biology, Concepts and Practice for the Future of Biomedical Research
Sprache:
- Wird nur auf Englisch angeboten
Bemerkungen:
(Ist Teilmodul von CS4516-KP12, CS5400)Veranstaltungen auch genutzt in CS4442-KP12.
Letzte Änderungen:
29.10.2019